Winding direction of ropes as a model

Bachelor or Master theses

Winding direction of ropes as a model
Image: Jan-Peter Kasper (University of Jena)
Notice

The topics are adapted to the respective scope for bachelor's or master's theses.
- The topics can also be used for the bioinformatics project module as stated or in a modified form.
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Interested persons from other institutions please contact the bioinformatics staff.


 Bachelorarbeiten/Masterarbeiten

  • Spieltheoretische Beschreibung der Verteilung von L- und D-Aminosäuren in Lebewesen
    Betreuer: Prof. Dr. Stefan Schuster

  • Analyse von biologischen Situationen, die mit dem Koordinierungs-Spiel modelliert werden können
    Betreuer: Prof. Dr. Stefan Schuster

  • Anwendung der adiabatischen Näherung auf die Simulation biologischer Prozesse und Vergleich mit der Quasi-Stationaritäts-Näherung
    Betreuer: Prof. Dr. Stefan Schuster

  • Untersuchung der optimalen Packung von Aminosäuren in verschiedenen Helices
    Betreuer: Prof. Dr. Stefan Schuster

  • Untersuchungen zur Teilwortkomplexität von biologischen Sequenzen
    Prof. Dr. Stefan Schuster

  • Modellierung von Oszillationen („red-queen cycles“) in Wirt-Pathogen- oder Pflanzen-Herbivor-Interaktionen
    Betreuer: Prof. Dr. Stefan Schuster

  • Vergleich der Enzymkinetiken bei reversibler und irreversibler Inhibition
    Betreuer: Prof. Dr. Stefan Schuster

  • Berechnung der räumlichen Periode von coiled-coils  DetailsExternal link
    Betreuer: Prof. Dr. Stefan Schuster

  • Statistische Analyse der Häufigkeit von Stop-Codons in Introns  DetailsExternal link
    Betreuer: Prof. Dr. Stefan Schuster, Valentin Wesp

  • Evolution der Aminosäurehäufigkeit in Proteomen im Zusammenhang mit dem genetischen Code
    Betreuer: Prof. Dr. Stefan Schuster, Prof. Günter Theißen

  • Ermittlung der Elementarmoden für ein spezifisches Teilsystem des Metabolismus in einem spezifischen Organismus  DetailsExternal link
    Betreuer: Prof. Dr. Stefan Schuster, Lukas Korn

  • Vergleich des aus unterschiedlich effizienter Ressourcennutzung resultierenden Gefangenendilemmas im Metabolismus und in der Konkurrenz von Wirtschaftsbetrieben. DetailsExternal link
    Betreuer: Prof. Dr. Stefan Schuster

  • Vergleich von Coiled-coil-Strukturen in Proteinen mit Flechtstrukturen in Kordeln und Seilen. 
    Betreuer: Prof. Dr. Stefan Schuster

  • Spieltheoretische Modellierung der Interaktion von Mikroorganismen, welche biotechnologisch relevante Substanzen austauschen DetailsExternal link
    Betreuer: Prof. Dr. Stefan Schuster

  • Datenanalyse von Perioden hydrophober Aminosäure in Sequenzen von Coiled-Coils  DetailsThis link requires a loginde
    Betreuer: Prof. Stefan Schuster

  • Quantitative and qualitative modeling of defense, counter-defense and counter-counter-defense   DetailsThis link requires a loginde
    Betreuer: Prof. Stefan Schuster

  • Modellierung der Evolution von Abwehrstrategien in Wirt-Pathogen-Interaktionen mittels Spieltheorie Detailspdf, 126 kb · de
    Betreuer: Prof. Stefan Schuster

  • Globaler Transport von Organismen in künstlichen als auch natürlichen Transportsystemen (Viren, Bakterien, höhere Organismen, ...) DetailsExternal link
    Betreuer: Dr. Heiko Stark

  • Vergleich artspezifischer Proteinstrukturen (Myosin, Titin, Collagen,...) und mögliche neue Wege der Evolution (Sequenzanalyse).
    Betreuer: Dr. Heiko Stark

  • Nähere Untersuchungen von Protein-Superfamilien (Myosin, Cytochrome, Ion-channel, ...) im Hinblick auf ihre chemische Stabilität.
    Betreuer: Dr. Heiko Stark

  • Die Verteilung des Hämatokrits im Tierreich unter Berücksichtigung von abiotischen und biotischen Umweltfaktoren.
    Betreuer: Dr. Heiko Stark / Prof. Stefan Schuster

  • Themenkomplex "Identifizierung, Modellierung und Simulation (bio)chemischer Signalverarbeitungsmodule".
    Betreuer: PD Dr. Thomas Hinze
    Spezielle Themen dabei können sein:
    • Tief-, Hoch- und Bandpassfilter mit konfigurierbaren Frequenzgängen
    • Verstärker und Dämpfungselemente (z.B. gleitende Mittelwertbildner)
    • Modulatoren und Transmitter (kennlinienbasierte Signalwandler)
    • logische und arithmetische Verknüpfungseinheiten
    • Signalintegratoren
    • Differenzierglieder
    • Signalvergleicher
    • Verzögerungselemente (z.B. Totzeitglieder)
    • Speicher
    • Taktgeneratoren und Dirac-Elemente (Impulsgeneratoren)
    • Sensoren
    Es bietet sich an, pro Bachelorarbeit eine Auswahl von zwei bis drei der Modulklassen zu treffen.

Weitere Themen sind in Absprache mit dem Lehrstuhl ebenfalls möglich.

Kontakt:  

Die E-Mail-Adressen, Raumnummern und Telefonnummmern der Betreuer finden Sie im Mitarbeiterverzeichnis der Professur für Bioinformatik.

Stand: 11.06.2026